Σύμφωνα με ανακοίνωση του ιδρύματος, η πρυτανεία του Πολυτεχνείου Κρήτης θα απονείμει το Βραβείο Αριστείας 2016 στον καθηγητή της σχολής Μηχανικών Παραγωγής και Διοίκησης, Κωνσταντίνο Ζοπουνίδη, σε αναγνώριση του ερευνητικού του έργου στον τομέα της πολυκριτήριας ανάλυσης αποφάσεων κατά το ακαδημαϊκό έτος 2015-2016. Το Βραβείο Αριστείας απονέμεται για τέταρτη συνεχή χρονιά.
Ειδικά βραβεία σε τρεις καθηγητές του ιδρύματος θα απονείμει το Πολυτεχνείο Κρήτης, στο πλαίσιο της τελετής απονομής των μεταπτυχιακών και διδακτορικών διπλωμάτων του Πολυτεχνείου, η οποία θα πραγματοποιηθεί την Παρασκευή, 16 Δεκεμβρίου 2016, στις 6.30 το απόγευμα, στο Κέντρο Αρχιτεκτονικής Μεσογείου, στην παλιά πόλη των Χανίων.
Ακόμα, η πρυτανεία θα απονείμει το Βραβείο Εξαίρετης Διδασκαλίας 2016 στον καθηγητή της σχολής Μηχανικών Ορυκτών Πόρων, Μιχαήλ Γαλετάκη, σε αναγνώριση του διδακτικού του έργου σε προπτυχιακό επίπεδο. Το Βραβείο Εξαίρετης Διδασκαλίας απονέμεται για τρίτη συνεχή χρονιά.
Η τρίτη απονομή αφορά το Βραβείο Εργαστηριακού Διδακτικού Έργου και θα δοθεί στην Αριάδνη Παντίδου της σχολής Μηχανικών Περιβάλλοντος σε αναγνώριση του εργαστηριακού διδακτικού της έργου. Το συγκεκριμένο βραβείο απονέμεται για δεύτερη συνεχή χρονιά.